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Publikationen

Detect de novo expressed ORFs in transcriptomes with DESwoMAN Grandchamp, Anna; Lebherz, Marie; Dohmen, Elias (2026) In: NAR Genomics and Bioinformatics, 8(4). doi:10.1093/nargab/lqag114 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
DeNoFo: a file format and toolkit for standardized, comparable de novo gene annotation Dohmen, Elias; Aubel, Margaux; Eicholt A, Lars; Roginski, Paul; Luria, Victor; Karger Amir; Grandchamp, Anna (2025) In: Bioinformatics, 41(10). doi:10.1093/bioinformatics/btaf539 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
DNA Transposons Favor De Novo Transcript Emergence Through Enrichment of Transcription Factor Binding Motifs Lebherz, Marie Kristin; Fouks, Bertrand; Schmidt, Julian; Bornberg-Bauer, Erich; Grandchamp, Anna (2024) In: Genome Biology and Evolution, 16(7). doi:10.1093/gbe/evae134 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
How antisense transcripts can evolve to encode novel proteins Iyengar, Bharat Ravi; Grandchamp, Anna; Bornberg-Bauer, Erich (2024) In: Nature Communications, 15(1). doi:10.1038/s41467-024-50550-3 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Quantification and modeling of turnover dynamics of de novo transcripts in Drosophila melanogaster Grandchamp, Anna; Czuppon, Peter; Bornberg-Bauer, Erich (2024) In: Nucleic Acids Research, 52(1). doi:10.1093/nar/gkad1079 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht

Detect de novo expressed ORFs in transcriptomes with DESwoMAN Grandchamp, Anna; Lebherz, Marie; Dohmen, Elias (2026) In: NAR Genomics and Bioinformatics, 8(4). doi:10.1093/nargab/lqag114 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
DeNoFo: a file format and toolkit for standardized, comparable de novo gene annotation Dohmen, Elias; Aubel, Margaux; Eicholt A, Lars; Roginski, Paul; Luria, Victor; Karger Amir; Grandchamp, Anna (2025) In: Bioinformatics, 41(10). doi:10.1093/bioinformatics/btaf539 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
DNA Transposons Favor De Novo Transcript Emergence Through Enrichment of Transcription Factor Binding Motifs Lebherz, Marie Kristin; Fouks, Bertrand; Schmidt, Julian; Bornberg-Bauer, Erich; Grandchamp, Anna (2024) In: Genome Biology and Evolution, 16(7). doi:10.1093/gbe/evae134 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
How antisense transcripts can evolve to encode novel proteins Iyengar, Bharat Ravi; Grandchamp, Anna; Bornberg-Bauer, Erich (2024) In: Nature Communications, 15(1). doi:10.1038/s41467-024-50550-3 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht
Quantification and modeling of turnover dynamics of de novo transcripts in Drosophila melanogaster Grandchamp, Anna; Czuppon, Peter; Bornberg-Bauer, Erich (2024) In: Nucleic Acids Research, 52(1). doi:10.1093/nar/gkad1079 Forschungsartikel (Zeitschrift) \| Peer reviewed \| Veröffentlicht